Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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