Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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