Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RubcnlQ3TD16 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms