Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc2Q3SXD3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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