Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms