Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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