Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Traf3ip1Q149C2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Traf3ip1Q149C2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Traf3ip1Q149C2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms