Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms