Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms