Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms