Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cntnap5bQ0V8T8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cntnap5bQ0V8T8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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