Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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