Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nfe2Q07279 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms