Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms