Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms