Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb2Q00977 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms