Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms