Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PgrQ00175 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms