Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms