Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nbr1P97432 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nbr1P97432 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms