Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cbx1P83917 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cbx1P83917 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cbx1P83917 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cbx1P83917 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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