Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnrpfP62307 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpfP62307 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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