Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp46P62069 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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