Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2kP61087 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms