Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms