Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CartptP56388 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CartptP56388 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CartptP56388 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CartptP56388 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms