Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NcanP55066 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NcanP55066 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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