Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lbx1P52955 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms