Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SqleP52019 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SqleP52019 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SqleP52019 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SqleP52019 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SqleP52019 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SqleP52019 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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