Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms