Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13P47963 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms