Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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