Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sept1P42209 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sept1P42209 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms