Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Mmp9P41245 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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