Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp4P35123 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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