Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc3P33622 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms