Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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