Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc10P31257 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms