Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb1P28230 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms