Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Znf239P24399 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms