Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3aP23116 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms