Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a2P20490 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms