Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PdgfaP20033 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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