Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl13aP19253 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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