Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Csn1s1P19228 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Csn1s1P19228 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Csn1s1P19228 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Csn1s1P19228 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csn1s1P19228 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms