Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18532 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P18532 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P18532 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms