Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18530 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18530 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms