Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl9P18340 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms