Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtpraP18052 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtpraP18052 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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