Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme1P15532 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms